在MATLAB中可调用的C或Fortran语言程序称为MEX文件。MATLAB可以直接把MEX文件视为它的内建函数进行调用。MEX文件是动态链接的子例程，MATLAB解释器可以自动载入并执行它。MEX文件中，MATLAB是程序的主体，MEX文件是被MATLAB调用的子程序。
MEX文件主要有以下方面的运用：
·在MATLAB中，M文件的计算速度特别是循环迭代速度远比C程序慢，因此，可以把要求大量循环迭代部分，用C语言编写为MEX文件，提高计算速度；
·对已经开发的C语言程序，则不必转化为M文件而重复劳动，通过添加接口程序转为MEX文件，由MATLAB调用；
·MATLAB调用C语言编写MEX文件，可充分发挥C语言对低级硬件操作的优越性能，实现对A/D采集卡、D/A输出卡等低级硬件操作。